Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms