Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms