Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
REPIN1Q9BWE0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 RAB30-AS1-205ENST00000530270 1116 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms