Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms