Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms