Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms