Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms