Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX27Q96L92 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms