Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms