Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms