Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms