Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms