Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms