Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms