Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPRY1Q96DX4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms