Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUB2Q96DC9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms