Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms