Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms