Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
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