Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATAD2BQ8WXI9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms