Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD9

CASKIN1, Caskin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN1Q8WXD9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CASKIN1Q8WXD9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CASKIN1Q8WXD9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CASKIN1Q8WXD9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CASKIN1Q8WXD9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CASKIN1Q8WXD9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CASKIN1Q8WXD9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CASKIN1Q8WXD9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CASKIN1Q8WXD9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASKIN1Q8WXD9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CASKIN1Q8WXD9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASKIN1Q8WXD9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASKIN1Q8WXD9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASKIN1Q8WXD9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASKIN1Q8WXD9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASKIN1Q8WXD9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASKIN1Q8WXD9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CASKIN1Q8WXD9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms