Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms