Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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FAT3Q8TDW7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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FAT3Q8TDW7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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FAT3Q8TDW7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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FAT3Q8TDW7 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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FAT3Q8TDW7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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FAT3Q8TDW7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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