Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.5 ms