Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms