Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms