Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms