Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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DTX3Q8N9I9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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DTX3Q8N9I9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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DTX3Q8N9I9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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DTX3Q8N9I9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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DTX3Q8N9I9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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DTX3Q8N9I9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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DTX3Q8N9I9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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DTX3Q8N9I9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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DTX3Q8N9I9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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