Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms