Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CRACR2BQ8N4Y2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2BQ8N4Y2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2BQ8N4Y2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2BQ8N4Y2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2BQ8N4Y2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2BQ8N4Y2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2BQ8N4Y2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2BQ8N4Y2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2BQ8N4Y2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2BQ8N4Y2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2BQ8N4Y2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2BQ8N4Y2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2BQ8N4Y2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2BQ8N4Y2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2BQ8N4Y2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2BQ8N4Y2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2BQ8N4Y2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2BQ8N4Y2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2BQ8N4Y2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2BQ8N4Y2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2BQ8N4Y2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2BQ8N4Y2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2BQ8N4Y2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRACR2BQ8N4Y2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRACR2BQ8N4Y2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRACR2BQ8N4Y2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRACR2BQ8N4Y2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRACR2BQ8N4Y2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRACR2BQ8N4Y2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms