Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms