Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms