Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R42Q7Z4L9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms