Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms