Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N1

COPS6, COP9 signalosome complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS6Q7L5N1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms