Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSH2Q76I76 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms