Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
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