Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUM4

ARHGAP27, Rho GTPase-activating protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP27Q6ZUM4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP27Q6ZUM4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP27Q6ZUM4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP27Q6ZUM4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP27Q6ZUM4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP27Q6ZUM4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP27Q6ZUM4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP27Q6ZUM4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP27Q6ZUM4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP27Q6ZUM4 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP27Q6ZUM4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP27Q6ZUM4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP27Q6ZUM4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP27Q6ZUM4 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP27Q6ZUM4 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP27Q6ZUM4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP27Q6ZUM4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP27Q6ZUM4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP27Q6ZUM4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP27Q6ZUM4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP27Q6ZUM4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms