Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms