Protein–RNA interactions for Protein: Q6VAB6

KSR2, Kinase suppressor of Ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR2Q6VAB6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KSR2Q6VAB6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR2Q6VAB6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR2Q6VAB6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR2Q6VAB6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR2Q6VAB6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR2Q6VAB6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR2Q6VAB6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR2Q6VAB6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR2Q6VAB6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR2Q6VAB6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR2Q6VAB6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR2Q6VAB6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR2Q6VAB6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR2Q6VAB6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KSR2Q6VAB6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KSR2Q6VAB6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KSR2Q6VAB6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KSR2Q6VAB6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KSR2Q6VAB6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KSR2Q6VAB6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KSR2Q6VAB6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KSR2Q6VAB6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KSR2Q6VAB6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KSR2Q6VAB6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KSR2Q6VAB6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms