Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms