Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms