Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms