Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms