Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms