Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK3

ZKSCAN2, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 2, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN2Q63HK3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZKSCAN2Q63HK3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZKSCAN2Q63HK3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ZKSCAN2Q63HK3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZKSCAN2Q63HK3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZKSCAN2Q63HK3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZKSCAN2Q63HK3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZKSCAN2Q63HK3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZKSCAN2Q63HK3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZKSCAN2Q63HK3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZKSCAN2Q63HK3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZKSCAN2Q63HK3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZKSCAN2Q63HK3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZKSCAN2Q63HK3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZKSCAN2Q63HK3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZKSCAN2Q63HK3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZKSCAN2Q63HK3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZKSCAN2Q63HK3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZKSCAN2Q63HK3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZKSCAN2Q63HK3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZKSCAN2Q63HK3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZKSCAN2Q63HK3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZKSCAN2Q63HK3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZKSCAN2Q63HK3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZKSCAN2Q63HK3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZKSCAN2Q63HK3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZKSCAN2Q63HK3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZKSCAN2Q63HK3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZKSCAN2Q63HK3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZKSCAN2Q63HK3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms