Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms