Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms