Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QL3Q5VWW1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QL3Q5VWW1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms