Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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PDZK1Q5T2W1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PDZK1Q5T2W1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PDZK1Q5T2W1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PDZK1Q5T2W1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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PDZK1Q5T2W1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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PDZK1Q5T2W1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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PDZK1Q5T2W1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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PDZK1Q5T2W1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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PDZK1Q5T2W1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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PDZK1Q5T2W1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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PDZK1Q5T2W1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDZK1Q5T2W1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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